一、肝臟受到外來損傷，比如肝炎、外傷，這時可能會出現甲胎蛋白的輕度升高。
二、一些特別嚴重的疾病，比如原發性肝細胞肝癌。因為肝癌細胞會持續不斷的分泌甲胎蛋白，這時甲胎蛋白會出現明顯升高，升高到幾十倍甚至幾百倍以上。
三、生殖系統腫瘤，這時腫瘤會分泌一些甲胎蛋白，也會出現血清中的甲胎蛋白升高。
臨床如果見到甲胎蛋白輕度升高，需要進一步查看有沒有其他疾病；如果甲胎蛋白出現明顯升高，一定要高度警惕原發性肝細胞肝癌的可能。
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